1、溶解性：
前面曾敘述過陽離子染料分子中的成鹽烷基和陰離子基團影響染料的溶解性。此外，染色介質中如果有陰離子化合物，如陰離子型表面活性劑和陰離子染料，也會與陽離子染料結合形成沉淀。毛/腈、滌/腈等混紡織物不能用普通陽離子染料與酸性、活性、分散等染料同浴染色，否則將產生沉淀。一般加入防沉淀劑來解決此類問題。
2、對pH值敏感性：
一般陽離子染料穩定的pH范圍是2.5～5.5。當pH值較低時，染料分子中的氨基被質子化，由給電子轉變為吸電子基，引起染料顏色發生變化；若pH值較高，陽離子染料可能形成季胺堿，或結構被破壞，染料發生沉淀、變色或者褪色現象。如噁嗪染料在堿性介質中轉變為非陽離子染料，失去對腈綸纖維的親和力而不能上染。
3、配伍性：
陽離子染料對腈綸纖維的親和力比較大，在纖維中的遷移性能不好，難以勻染。不同染料對同一纖維的親和力不同，在纖維內部的擴散速率也不相同，當上染速率差別較大的染料進行拼混時，染色過程中容易發生色澤變化、染色不勻的現象；而上染速率接近的染料拼混時，它們在染浴里濃度比例基本不變，使產品的色澤保持一致，染色比較均勻。這種染料拼染的性能稱為染料的配伍性。
為了使用方便，人們用數值表示染料的配伍性能，通常用K 值表示。采用黃、藍兩色標準染料各一套，每套有五個上染速率不同的染料組成，共有五個配伍值（1，2，3，4，5），上染速率大的染料配伍值小，染料的遷移性和勻染性差，上染速率小的染料其配伍值大，染料的遷移性和勻染性較好。將待測染料與標準染料逐一進行拼染，然后對染色效果給予評價，定出待測染料的配伍值。
染料的配伍值和其分子結構存在一定的關系。染料分子中引入疏水性基團，水溶性下降，染料對纖維的親和力上升，上染速率提高，配伍值減小，在纖維上的遷移性和勻染性降低，給色量增加。染料分子中某些基團因幾何構型而引起空間障礙，也使染料對纖維的親和力下降，配伍值增加。
4、耐曬性能：
染料的耐曬性能與其分子結構有關。共軛型陽離子染料分子中陽離子基團是比較敏感的部位，受光能作用后易從陽離子基團所處位置活化，然后傳遞至整個發色系統，使之遭受破壞而褪色，共軛型三芳甲烷類、多甲川類和噁嗪類耐曬牢度都不好。隔離型陽離子染料分子中的陽離子基團與共軛系統間被聯結基隔開，即使在光能的作用下被活化，也不易將能量傳遞給發色的共軛系統，使之保存完好，所以耐曬牢度優于共軛型。
